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C57BL/6N-Tg(1.28HBV)/Vst乙肝病毒轉(zhuǎn)基因小鼠的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
新聞來源:CEIDI西遞 發(fā)布時(shí)間:2024-01-29

摘要:觀察 C57BL/ 6N-Tg (1. 28HBV) / Vst 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)轉(zhuǎn)基因(HBV-Tg) 小鼠模型的特征,并分析 HBV-Tg 小鼠模型的轉(zhuǎn)錄組學(xué)特點(diǎn)。

目的 觀察 C57BL/ 6N-Tg (1. 28HBV) / Vst 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)轉(zhuǎn)基因(HBV-Tg) 小鼠模型的特征,并分析 HBV-Tg 小鼠模型的轉(zhuǎn)錄組學(xué)特點(diǎn)。>>>商務(wù)洽談,點(diǎn)此處,在線咨詢

方法 以 10 只雄性 HBV-Tg 小鼠為實(shí)驗(yàn)組,10 只野 生型小鼠為對(duì)照組。 以血清 HBV DNA、HBsAg、HBeAg 水平和肝組織 HBsAg、HBcAg 表達(dá)情況評(píng)價(jià)模型小鼠病毒學(xué) 特征,檢測血清 ALT、AST,肝組織 HE、天狼猩紅染色及肝組織 Hyp 含量評(píng)估小鼠肝臟炎癥及纖維化程度。 兩組各 隨機(jī)選擇 3 例肝組織樣本提取 RNA 進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測序。 經(jīng) R 軟件分析獲得表達(dá)顯著的差異基因,經(jīng) GO 和 KEGG 分析獲得差異基因功能富集情況,再采用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR(RT-qPCR)對(duì)差異顯著的基因進(jìn)行驗(yàn)證。


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結(jié)果 與正常組相比,模型組 ALT、AST 水平均有所升高,以 ALT 更為顯著(P < 0. 05);模型組肝組織 HE 染色可見肝細(xì)胞 核增大,個(gè)別肝細(xì)胞出現(xiàn)腫脹。 天狼猩紅染色結(jié)果顯示,HBV 轉(zhuǎn)基因組匯管區(qū)及小葉間出現(xiàn)少量膠原沉積,呈細(xì)線 狀。 通過篩選條件( | logFC| > 2 倍且 P.adj < 0. 05)獲得差異基因共計(jì) 1352 個(gè),其中上調(diào)基因 703 個(gè),下調(diào)基因 649 個(gè)。 KEGG 分析提示差異基因主要在 PPAR 信號(hào)通路、視黃醇代謝、脂肪酸降解等通路中富集(P.adj < 0. 05)。 明 顯上調(diào)的差異基因主要有 Cyp4a10、Cyp4a14、Acot1、Acot3、Ehhadh 等,明顯下調(diào)基因包括 Scn5a、Apol10b、Igddc4、 Cxcl1、9530077C05Rik 等,經(jīng) RT-qPCR 驗(yàn)證趨勢(shì)一致(P < 0. 05)。

結(jié)論 HBV-Tg 小鼠具有自發(fā)纖維化的趨勢(shì),經(jīng) 轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,慢性乙型病毒性肝炎(chronic hepatits B, CHB)發(fā)生的潛在機(jī)制主要涉及 PPAR 信號(hào)通路、視黃醇 代謝、脂肪酸降解、藥物代謝等通路。

閱讀原文:C57BL╱6N-Tg(128HBV)╱Vst乙肝病毒轉(zhuǎn)基因小鼠的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析.pdf

來源:中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào)2023年第12期


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